Access to Biological Collections Data (ABCD) Schema är en långvarig, utvecklande och omfattande standard för tillgång till och utbyte av data om prover från naturhistoriska samlingar och fältobservationer, även kända som primära data om biologisk mångfald. Den är kompatibel med flera befintliga datastandarder. Potentialen för tillämpning av ABCD sträcker sig till interna nätverk, eller intern äldre dataåtkomst. ABCD är också en av flera modeller som kan omvandlas och mappas till EDM av OpenUp! aggregator. Innehållsleverantörer levererar sina data i ABCD(EFG)-schemat till OpenUp! med hjälp av BioCASe-tekniken, vilket gör deras innehåll fritt tillgängligt på Europeana Collections.
ABCD är redan tänkt att vara den viktigaste standarden för naturhistoriska samlingar som används i både nuvarande och kommande projekt och forskningsinfrastrukturinitiativ i Europa.
Vad är nytt?
Så vad har förbättrats med ABCD 3.0? Det är mycket. Ett nytt XML-schema utvecklades och ändringar gjordes när det gäller återanvändning av element (förenkling, mer konsekvent namngivning osv.). Förfrågningar från samhället uppfylldes också och nödvändig harmonisering med ABCD 3.0-ontologin uppnåddes. Spännande nog är det första gången som ABCD beskrivs som XML och ontologi. Detta ökar tillämpningen och användningen av standarden genom semantiska frågor och fungerar som en grund för framtida utveckling av programvara och tjänster i den semantiska webbmiljön. Dessutom kan olika applikationsscheman skapas som integrerar element från ABCD-ontologin och mer. Detta hjälper användarna att bestämma de lämpligaste elementen för offentliggörandet av deras data.
Bild: Miltitzia lutea (Hook. & Arn.) A. DC., Royal Botanic Garden Kew. Leverantör: Öppna! Tillstånd: Creative Commons Erkännande 4.0
För det första användningsfallet utvecklades ett applikationsschema för zoologiska insamlingsdata. Detta XML-schema är en delmängd av ABCD 3.0 och innehåller endast element som är viktiga för publicering och utbyte av information som beskriver zoologiska samlingsobjekt. Utöver element av allmän betydelse (t.ex. kontaktperson, anläggningsinstitution) ingår även mer specifika element som vetenskapligt namn, beredning av exemplaret eller dess utvecklingsstadium. Mer Ansökan Schemata planeras inklusive sådana för geovetenskapliga samlingsobjekt inklusive mineraler / stenar, fossiler och meteoriter.
Dessa förändringar och uppdateringar gjorde det möjligt för ABCD att hålla jämna steg med dynamiska förändringar i det tekniska ekosystemet. För 20 år sedan utvecklades ABCD enbart som en XML-standard som var hierarkiskt strukturerad med cirka 1500 enskilda element. Det var perfekt för den tiden eftersom XML är både mänskligt och maskinläsbart. Men nu finns det nya möjligheter - enskilda element är adresserbara och koncept kan kopplas till andra standarder.
Gemenskapernas behov och feedback
Under tiden (2015-2019) ABCD 3.0 utvecklades presenterade teamet från Botaniska trädgården och Botaniska museet Berlin och Museum für Naturkunde Berlin sin plan vid olika konferenser och organiserade workshops med olika vetenskapliga samfund. De kunde samla in krav på en lämplig datastandard. Resultaten från dessa workshops användes också för att revidera enskilda element och skapa applikationsschemat. Och efter finansieringsfasen kommer båda institutionerna att upprätthålla standarden och arbeta med ny utveckling.
Eftersom det inte har gått mycket tid sedan den släpptes har ABCD 3.0 ännu inte fått mycket feedback från gemenskapen. Svaren på de nya möjligheter som det ger har dock varit positiva. Den tidigare versionen, ABCD 2.06, är en ratificerad TDWG-standard (Biodiversity Information Standards). En ratificering av ABCD 3.0 är planerad för detta år. Förutom en expertgranskning driver TDWG (Biodiversity Information Standards) en gemenskapsgranskning, genom vilken alla uppmanas att ge feedback och idéer till förbättringar.
Vad händer härnäst?
Framtiden är ljus för ABCD 3.0 och dess roll som huvudstandard för projekt och forskningsinfrastrukturinitiativ i Europa. Teamet bakom ABCD 3.0 hoppas kunna arbeta närmare med experter på andra domänstandarder om särskilda ämnen som jordvetenskapliga prover och ha möjlighet att citera varandras element korrekt innan de skapar nya, vilket är ett stort steg mot mer interoperabla och sammanlänkade naturhistoriska data, i enlighet med principerna för länkade öppna data.
För att lära dig mer om ABCD 3.0 kan du hitta schemat på abcd.tdwg.org/ och på GitHub.
Om du är intresserad av att lära dig mer om taxonomier för data om biologisk mångfald kan du läsa Jörg Holetscheks inlägg.