Shema dostopa do podatkov o bioloških zbirkah (ABCD) je dolgoletni, razvijajoči se in celovit standard za dostop do podatkov o vzorcih iz zbirk naravne zgodovine in opazovanj na terenu ter njihovo izmenjavo, znan tudi kot primarni podatki o biotski raznovrstnosti. Združljiv je z več obstoječimi podatkovnimi standardi. Potencial za uporabo ABCD se razteza na notranja omrežja ali interni podedovani dostop do podatkov. ABCD je tudi eden od več modelov, ki jih je mogoče preoblikovati in preslikati v EDM z zbiralnikom OpenUp!. Ponudniki vsebin posredujejo svoje podatke v shemi ABCD (EFG) OpenUp! z uporabo tehnologije BioCASe, s čimer je njihova vsebina prosto dostopna v zbirkah Europeana.
ABCD je že predviden kot glavni standard za zbirke naravne zgodovine, ki se uporabljajo v sedanjih in prihodnjih projektih ter pobudah za raziskovalno infrastrukturo v Evropi.
Kaj je novega?
Kaj je izboljšano z ABCD 3.0? Veliko jih je. Razvita je bila nova shema XML in izvedene so bile spremembe v zvezi s ponovno uporabo elementov (poenostavitev, doslednejše poimenovanje itd.). Izpolnjene so bile tudi zahteve skupnosti in dosežena je bila potrebna uskladitev z ontologijo ABCD 3.0. Zanimivo je, da je ABCD prvič opisan kot XML in ontologija. To povečuje uporabo in uporabo standarda s semantičnimi poizvedbami in služi kot osnova za prihodnji razvoj programske opreme in storitev v semantičnem spletnem okolju. Poleg tega je mogoče ustvariti različne sheme aplikacij, ki vključujejo elemente iz ontologije ABCD in še več. To uporabnikom pomaga določiti najustreznejše elemente za objavo njihovih podatkov.
Slika: Miltitzia lutea (Kljuka. & Arn.) A. DC., Kraljevi botanični vrt Kew. Ponudnik: Odpri! Licenca: Creative Commons Priznanje avtorstva 4.0
Za prvi primer uporabe je bila razvita shema aplikacij za podatke o zoološkem zbiranju. Ta shema XML je podmnožica ABCD 3.0 in vsebuje le elemente, pomembne za objavo in izmenjavo informacij, ki opisujejo predmete zoološkega zbiranja. Poleg elementov splošnega pomena (npr. kontaktna oseba, nosilec) so vključeni tudi bolj specifični elementi, kot so znanstveno ime, priprava vzorca ali njegova razvojna faza. Načrtovanih je več aplikacijskih shem, vključno s tistimi za geoznanstvene predmete zbiranja, vključno z minerali / kamninami, fosili in meteoriti.
Te spremembe in posodobitve so ABCD omogočile, da je sledil dinamičnim spremembam v tehnološkem ekosistemu. Pred 20 leti je bil ABCD razvit izključno kot standard XML, ki je bil hierarhično strukturiran s približno 1.500 posameznimi elementi. Za ta čas je bil kot nalašč, saj je XML tako človeški kot strojno berljiv. Vendar pa zdaj obstajajo nove možnosti - posamezni elementi se lahko obravnavajo, koncepti pa se lahko povežejo z drugimi standardi.
Potrebe skupnosti in povratne informacije
V času razvoja ABCD 3.0 (2015-2019) je ekipa iz Botaničnega vrta in Botaničnega muzeja Berlin ter Museum für Naturkunde Berlin predstavila svoj načrt na različnih konferencah in organiziranih delavnicah z različnimi znanstvenimi skupnostmi. Zbrali so lahko zahteve za ustrezen podatkovni standard. Ugotovitve teh delavnic so bile uporabljene tudi za revizijo posameznih elementov in oblikovanje sheme uporabe. In po fazi financiranja bosta obe instituciji ohranili standard in delali na novem razvoju.
Ker od njegove izdaje ni minilo veliko časa, ABCD 3.0 od skupnosti še ni prejel veliko povratnih informacij. Vendar so bili odzivi v zvezi z novimi možnostmi, ki jih omogoča, pozitivni. Prejšnja različica, ABCD 2.06, je ratificiran standard TDWG (standardi za informacije o biotski raznovrstnosti). Ratifikacija ABCD 3.0 je načrtovana za letošnje leto. Poleg strokovnega pregleda TDWG (informacijski standardi za biotsko raznovrstnost) izvaja tudi pregled skupnosti, prek katerega so vsi vabljeni, da podajo povratne informacije in zamisli za izboljšave.
Kaj sledi?
Za ABCD 3.0 in njegovo vlogo glavnega standarda za projekte in pobude raziskovalne infrastrukture v Evropi je prihodnost svetla. Ekipa, ki stoji za ABCD 3.0, upa, da bo tesneje sodelovala s strokovnjaki o drugih domenskih standardih v zvezi s posebnimi temami, kot so primerki zemeljskih znanosti, in da bo lahko pravilno citirala elemente drug drugega, preden bo ustvarila nove, kar je velik korak k bolj interoperabilnim in medsebojno povezanim podatkom o naravni zgodovini v skladu z načeli povezanih odprtih podatkov.
Če želite izvedeti več o ABCD 3.0, lahko Schema najdete na abcd.tdwg.org/ in na GitHub.
Če vas zanima več o taksonomijah za podatke o biotski raznovrstnosti, si lahko preberete objavo Jörga Holetscheka.