Schemat dostępu do danych z kolekcji biologicznych (ABCD) jest wieloletnim, ewoluującym i kompleksowym standardem dostępu i wymiany danych o okazach ze zbiorów historii naturalnej i obserwacji polowych, znanym również jako pierwotne dane dotyczące różnorodności biologicznej. Jest kompatybilny z kilkoma istniejącymi standardami danych. Potencjał zastosowania ABCD rozciąga się na sieci wewnętrzne lub wewnętrzny dostęp do starszych danych. ABCD jest również jednym z kilku modeli, które można przekształcić i odwzorować na EDM za pomocą agregatora OpenUp!. Dostawcy treści dostarczają swoje dane w schemacie ABCD (EFG) do OpenUp! za pomocą technologii BioCASe, udostępniając swoje treści bezpłatnie w kolekcjach Europeana.
Przewiduje się już, że ABCD będzie głównym standardem dla zbiorów historii naturalnej wykorzystywanych zarówno w bieżących, jak i przyszłych projektach i inicjatywach w zakresie infrastruktury badawczej w Europie.
Co nowego?
Co zostało ulepszone dzięki ABCD 3.0? Dużo. Opracowano nowy schemat XML i wprowadzono modyfikacje dotyczące ponownego użycia elementów (uproszczenie, bardziej spójne nazewnictwo itp.). Zrealizowano również wnioski społeczności i osiągnięto niezbędną harmonizację z ontologią ABCD 3.0. Co ciekawe, po raz pierwszy ABCD opisano jako XML i ontologię. Zwiększa to zastosowanie i wykorzystanie standardu poprzez zapytania semantyczne i służy jako podstawa dla przyszłego rozwoju oprogramowania i usług w semantycznym środowisku internetowym. Dodatkowo można tworzyć różne schematy aplikacji, które integrują elementy z ontologii ABCD i nie tylko. Pomaga to użytkownikom określić najbardziej odpowiednie elementy do publikacji ich danych.
Zdjęcie: Miltitzia lutea (Hook. & Arn.) A. DC., Królewski Ogród Botaniczny Kew. Dostawca: Otwórz! Licencja: Creative Commons Uznanie autorstwa 4.0
W pierwszym przypadku użycia opracowano schemat aplikacji dla danych z kolekcji zoologicznej. Ten schemat XML jest podzbiorem ABCD 3.0 i zawiera tylko elementy ważne dla publikacji i wymiany informacji opisujących obiekty kolekcji zoologicznej. Oprócz elementów o znaczeniu ogólnym (np. osoba wyznaczona do kontaktów, instytucja przetrzymująca) uwzględniono również bardziej szczegółowe elementy, takie jak nazwa naukowa, przygotowanie okazu lub jego etap rozwojowy. Planowane są dalsze schematy zastosowań, w tym dla obiektów geonaukowych, w tym minerałów / skał, skamielin i meteorytów.
Te zmiany i aktualizacje pozwoliły ABCD nadążyć za dynamicznymi zmianami w ekosystemie technologicznym. 20 lat temu ABCD został opracowany wyłącznie jako standard XML, który był hierarchicznie skonstruowany z około 1500 pojedynczych elementów. To było idealne na ten czas, ponieważ XML jest zarówno do odczytu przez człowieka, jak i maszynę. Teraz jednak pojawiają się nowe możliwości - pojedyncze elementy są możliwe do rozwiązania, a koncepcje można powiązać z innymi standardami.
Potrzeby społeczności i informacje zwrotne
W tym czasie (2015-2019) opracowano ABCD 3.0, zespół z Ogrodu Botanicznego i Muzeum Botanicznego w Berlinie oraz Museum für Naturkunde Berlin przedstawił swój plan na różnych konferencjach i zorganizował warsztaty z różnymi środowiskami naukowymi. Udało im się zebrać wymagania dotyczące odpowiedniego standardu danych. Ustalenia z tych warsztatów wykorzystano również do przeglądu pojedynczych elementów i stworzenia schematu aplikacji. Po zakończeniu fazy finansowania obie instytucje utrzymają standard i będą pracować nad nowymi rozwiązaniami.
Ponieważ od premiery nie upłynęło wiele czasu, ABCD 3.0 nie otrzymało jeszcze wielu informacji zwrotnych od społeczności. Jednak odpowiedzi dotyczące nowych możliwości, na które pozwala, były pozytywne. Poprzednia wersja, ABCD 2.06, jest ratyfikowanym standardem TDWG (Biodiversity Information Standards). W tym roku planowana jest ratyfikacja ABCD 3.0. Oprócz przeglądu eksperckiego TDWG (Biodiversity Information Standards) przeprowadza przegląd społeczności, w ramach którego wszyscy są proszeni o przekazywanie opinii i pomysłów na ulepszenie.
Co dalej?
Przyszłość ABCD 3.0 i jego roli jako głównego standardu dla projektów i inicjatyw w zakresie infrastruktury badawczej w Europie jest jasna. Zespół stojący za ABCD 3.0 ma nadzieję na bliższą współpracę z ekspertami w zakresie innych standardów dziedzinowych dotyczących konkretnych tematów, takich jak próbki nauk o Ziemi, oraz na możliwość prawidłowego cytowania elementów innych osób przed stworzeniem nowych, co jest dużym krokiem w kierunku bardziej interoperacyjnych i wzajemnie powiązanych danych z historii naturalnej, zgodnie z zasadami Powiązanych Otwartych Danych.
Więcej informacji na temat ABCD 3.0 można znaleźć na stronie abcd.tdwg.org/ oraz na GitHub.
Jeśli chcesz dowiedzieć się więcej o taksonomii danych dotyczących różnorodności biologicznej, przeczytaj post Jörga Holetscheka.