Le schéma d'accès aux données sur les collections biologiques (ABCD) est une norme de longue date, évolutive et complète pour l'accès et l'échange de données sur les spécimens provenant de collections d'histoire naturelle et d'observations sur le terrain, également connues sous le nom de données primaires sur la biodiversité. Il est compatible avec plusieurs normes de données existantes. Le potentiel d'application de l'ABCD s'étend aux réseaux internes ou à l'accès interne aux données héritées. ABCD est également l'un des nombreux modèles qui peuvent être transformés et mappés à EDM par l'agrégateur OpenUp!. Les fournisseurs de contenu livrent leurs données dans le schéma ABCD (EFG) à OpenUp! en utilisant la technologie BioCASe, rendant leur contenu disponible gratuitement sur Europeana Collections.
Il est déjà prévu que l'ABCD soit la principale norme pour les collections d'histoire naturelle utilisées dans le cadre de projets actuels et à venir et d'initiatives d'infrastructures de recherche en Europe.
Quoi de neuf?
Qu'est-ce qui a été amélioré avec ABCD 3.0? Beaucoup. Un nouveau schéma XML a été développé et des modifications ont été apportées en ce qui concerne la réutilisation des éléments (simplification, nommage plus cohérent, etc.). Les demandes de la communauté ont également été satisfaites et l'harmonisation nécessaire avec l'ontologie ABCD 3.0 a été réalisée. Il est intéressant de noter que c’est la première fois que l’ABCD est décrit comme XML et ontologie. Cela augmente l'application et l'utilisation de la norme par le biais de requêtes sémantiques et sert de base aux développements futurs de logiciels et de services dans l'environnement Web sémantique. En outre, différents schémas d'application peuvent être créés qui intègrent des éléments de l'ontologie ABCD et plus encore. Cela aide les utilisateurs à déterminer les éléments les plus appropriés pour la publication de leurs données.
Image : Miltitzia lutea (Hook. & Arn.) A. DC., Jardin botanique royal de Kew. Prestataire: Ouvrir! Licence : Creative Commons Attribution 4.0
Pour le premier cas d'utilisation, un schéma d'application pour les données de collecte zoologique a été développé. Ce schéma XML est un sous-ensemble de ABCD 3.0 et ne contient que des éléments importants pour la publication et l'échange d'informations décrivant des objets de collection zoologiques. Outre les éléments d'importance générale (par exemple, personne de contact, établissement détenteur), des éléments plus spécifiques tels que le nom scientifique, la préparation du spécimen ou son stade de développement sont également inclus. Des schémas d'application sont prévus, y compris ceux pour les objets de collection géoscientifiques, y compris les minéraux / roches, les fossiles et les météorites.
Ces changements et mises à jour ont permis à ABCD de suivre les changements dynamiques de l'écosystème technologique. Il y a 20 ans, ABCD a été développé uniquement en tant que norme XML structurée hiérarchiquement avec environ 1 500 éléments uniques. C'était parfait pour cette époque puisque XML est à la fois humain et lisible par machine. Cependant, il y a maintenant de nouvelles possibilités - des éléments uniques sont adressables et les concepts peuvent être liés à d'autres normes.
Besoins et retours d'information de la communauté
Au cours de la période (2015-2019) ABCD 3.0 a été développé, l'équipe du Jardin botanique et du Musée botanique de Berlin et du Museum für Naturkunde Berlin a présenté leur plan lors de diverses conférences et organisé des ateliers avec différentes communautés scientifiques. Ils ont été en mesure de recueillir des exigences pour une norme de données appropriée. Les résultats de ces ateliers ont également été utilisés pour réviser des éléments uniques et créer le schéma d'application. Et, après la phase de financement, les deux institutions maintiendront la norme et travailleront sur de nouveaux développements.
Comme peu de temps s’est écoulé depuis sa sortie, ABCD 3.0 n’a pas encore reçu beaucoup de commentaires de la part de la communauté. Cependant, les réponses concernant les nouvelles possibilités qu'il permet ont été positives. L'ancienne version, ABCD 2.06, est une norme TDWG ratifiée (Biodiversity Information Standards). Une ratification de l'ABCD 3.0 est prévue pour cette année. En plus d'un examen par des experts, le TDWG (Biodiversity Information Standards) effectue un examen par la communauté, à travers lequel tout le monde est invité à donner des commentaires et des idées d'amélioration.
Quelle est la suite?
L'avenir est prometteur pour ABCD 3.0 et son rôle en tant que norme principale pour les projets et les initiatives d'infrastructures de recherche en Europe. L'équipe derrière ABCD 3.0 espère travailler plus étroitement avec des experts sur d'autres normes de domaine sur des sujets particuliers tels que les spécimens de sciences de la terre et avoir la capacité de citer correctement les éléments des uns et des autres avant d'en créer de nouveaux, ce qui constitue un grand pas vers des données d'histoire naturelle plus interopérables et interconnectées, conformément aux principes des données ouvertes liées.
Pour en savoir plus sur ABCD 3.0, vous pouvez trouver le schéma sur abcd.tdwg.org/ et sur GitHub.
Si vous souhaitez en savoir plus sur les taxonomies pour les données sur la biodiversité, vous pouvez lire l’article de Jörg Holetschek.