Schéma prístupu k údajom z biologických zbierok (ABCD) je dlhodobým, vyvíjajúcim sa a komplexným štandardom pre prístup k údajom a výmenu údajov o exemplároch zo zbierok s prírodnou históriou a z pozorovaní v teréne, ktoré sú známe aj ako primárne údaje o biodiverzite. Je kompatibilný s viacerými existujúcimi dátovými štandardmi. Potenciál na uplatňovanie ABCD sa rozširuje na interné siete alebo interný pôvodný prístup k údajom. ABCD je tiež jedným z niekoľkých modelov, ktoré môžu byť transformované a mapované do EDM agregátorom OpenUp!. Poskytovatelia obsahu dodávajú svoje údaje v schéme ABCD(EFG) spoločnosti OpenUp! pomocou technológie BioCASe a voľne sprístupňujú svoj obsah v zbierkach Europeany.
Predpokladá sa, že ABCD už bude hlavným štandardom pre zbierky prírodných dejín používané v súčasných aj budúcich projektoch a iniciatívach v oblasti výskumnej infraštruktúry v Európe.
Čo je nové?
Čo bolo vylepšené s ABCD 3.0? Veľa. Vypracovala sa nová schéma XML a vykonali sa úpravy týkajúce sa opätovného použitia prvkov (zjednodušenie, konzistentnejšie pomenovanie atď.). Splnili sa aj požiadavky komunity a dosiahla sa potrebná harmonizácia s ontológiou ABCD 3.0. Vzrušujúce je, že je to prvýkrát, čo sa ABCD opisuje ako XML a ontológia. Tým sa zvyšuje aplikácia a používanie štandardu prostredníctvom sémantických dopytov a slúži ako základ pre budúci vývoj softvéru a služieb v sémantickom webovom prostredí. Okrem toho je možné vytvoriť rôzne schémy aplikácií, ktoré integrujú prvky z ontológie ABCD a ďalšie. To pomáha používateľom určiť najvhodnejšie prvky na zverejnenie ich údajov.
Obrázok: Miltitzia lutea (Háčik. A. DC., Kráľovská botanická záhrada Kew. Poskytovateľ: OpenUp! Licencia: Commons ponúka multimediálne súbory na tému Atribúcia 4.0
Pre prvý prípad použitia bola vypracovaná aplikačná schéma pre zoologické zberné údaje. Táto schéma XML je podmnožinou ABCD 3.0 a obsahuje len prvky dôležité pre uverejňovanie a výmenu informácií opisujúcich objekty zoologického zberu. Okrem prvkov všeobecného významu (napr. kontaktná osoba, holdingová inštitúcia) sú zahrnuté aj špecifickejšie prvky, ako je vedecký názov, príprava vzorky alebo jej vývojové štádium. Plánujú sa ďalšie aplikačné schémy vrátane schém pre geovedné zberné objekty vrátane nerastov / hornín, fosílií a meteoritov.
Tieto zmeny a aktualizácie umožnili ABCD držať krok s dynamickými zmenami v technologickom ekosystéme. Pred 20 rokmi bol ABCD vyvinutý výhradne ako štandard XML, ktorý bol hierarchicky štruktúrovaný s približne 1 500 jednotlivými prvkami. To bolo ideálne pre túto dobu, pretože XML je ľudské a strojovo čitateľné. Teraz však existujú nové možnosti - jednotlivé prvky sú adresovateľné a koncepcie môžu byť prepojené s inými normami.
Potreby a spätná väzba komunity
V čase (2015-2019) bol vyvinutý ABCD 3.0, tím z Botanickej záhrady a Botanického múzea v Berlíne a Museum für Naturkunde v Berlíne predstavil svoj plán na rôznych konferenciách a organizovaných workshopoch s rôznymi vedeckými komunitami. Podarilo sa im zozbierať požiadavky na vhodný dátový štandard. Zistenia z týchto seminárov sa použili aj na revíziu jednotlivých prvkov a vytvorenie aplikačnej schémy. A po fáze financovania si obe inštitúcie zachovajú štandard a budú pracovať na novom vývoji.
Keďže od jeho vydania neuplynulo veľa času, spoločnosť ABCD 3.0 zatiaľ nedostala od komunity veľa spätnej väzby. Odpovede týkajúce sa nových možností, ktoré umožňuje, však boli pozitívne. Pôvodná verzia ABCD 2.06 je ratifikovaným štandardom TDWG (Biodiversity Information Standards). Ratifikácia ABCD 3.0 je naplánovaná na tento rok. Okrem odborného preskúmania vykonáva TDWG (Biodiversity Information Standards – normy pre informácie o biodiverzite) aj komunitné preskúmanie, prostredníctvom ktorého sa každý vyzýva, aby poskytol spätnú väzbu a nápady na zlepšenie.
Čo bude ďalej?
Budúcnosť je jasná pre ABCD 3.0 a jeho úlohu ako hlavného štandardu pre projekty a iniciatívy v oblasti výskumnej infraštruktúry v Európe. Tím, ktorý stojí za ABCD 3.0, dúfa, že bude užšie spolupracovať s odborníkmi na iné doménové štandardy v konkrétnych témach, ako sú vzorky prírodných vied, a že bude schopný správne citovať navzájom prvky pred vytvorením nových, čo je veľký krok smerom k interoperabilnejším a vzájomne prepojeným údajom o prírodnej histórii v súlade so zásadami prepojených otvorených dát.
Ak sa chcete dozvedieť viac o ABCD 3.0, schému nájdete na adrese abcd.tdwg.org/ a na GitHub.
Ak máte záujem dozvedieť sa viac o taxonómiách údajov o biodiverzite, môžete si prečítať príspevok Jörga Holetscheka.