Schéma přístupu k údajům z biologických sbírek (ABCD) je dlouhodobým, vyvíjejícím se a komplexním standardem pro přístup k údajům o exemplářích ze sbírek přírodní historie a pozorování v terénu, známým také jako primární údaje o biologické rozmanitosti, a pro jejich výměnu. Je kompatibilní s několika existujícími datovými standardy. Potenciál pro aplikaci ABCD se vztahuje i na interní sítě nebo interní přístup ke starším datům. ABCD je také jedním z několika modelů, které mohou být transformovány a mapovány na EDM agregátorem OpenUp!. Poskytovatelé obsahu dodávají svá data ve schématu ABCD(EFG) do OpenUp! pomocí technologie BioCASe, čímž svůj obsah volně zpřístupňují na Europeana Collections.
Předpokládá se, že ABCD bude hlavním standardem pro přírodovědné sbírky používané v současných i připravovaných projektech a iniciativách v oblasti výzkumné infrastruktury v Evropě.
Co je nového?
Co se zlepšilo s ABCD 3.0? Hodně. Bylo vyvinuto nové schéma XML a byly provedeny úpravy týkající se opětovného použití prvků (zjednodušení, konzistentnější pojmenování atd.). Byly rovněž splněny požadavky komunity a bylo dosaženo nezbytné harmonizace s ontologií ABCD 3.0. Zajímavé je, že je to poprvé, co je ABCD popsáno jako XML a ontologie. To zvyšuje aplikaci a využití standardu prostřednictvím sémantických dotazů a slouží jako základ pro budoucí vývoj softwaru a služeb v sémantickém webovém prostředí. Kromě toho mohou být vytvořeny různé schémata aplikací, které integrují prvky z ontologie ABCD a další. To pomáhá uživatelům určit nejvhodnější prvky pro zveřejnění jejich údajů.
Obrázek: Miltitzia lutea (Hook. Přidat štítky pro "Arn.) A. DC., Royal Botanic Garden Kew. Poskytovatel: Otevřete se! Licence: Creative Commons Uveďte původ 4.0
Pro první případ použití bylo vyvinuto aplikační schéma pro data zoologického sběru. Toto schéma XML je podmnožinou ABCD 3.0 a obsahuje pouze prvky důležité pro publikaci a výměnu informací popisujících objekty zoologické sbírky. Kromě prvků obecného významu (např. kontaktní osoba, holdingová instituce) jsou zahrnuty i konkrétnější prvky, jako je vědecký název, příprava exempláře nebo jeho vývojové stadium. Plánují se další aplikační schémata včetně schémat pro geovědní sbírkové objekty včetně minerálů/kamen, fosilií a meteoritů.
Tyto změny a aktualizace umožnily ABCD držet krok s dynamickými změnami v technologickém ekosystému. Před 20 lety byl ABCD vyvinut pouze jako standard XML, který byl hierarchicky strukturován s asi 1500 jednotlivými prvky. Bylo to perfektní pro tuto dobu, protože XML je jak lidské, tak strojově čitelné. Nyní však existují nové možnosti - jednotlivé prvky jsou adresovatelné a koncepty mohou být propojeny s jinými standardy.
Potřeby komunity a zpětná vazba
Během vývoje (2015-2019) ABCD 3.0 představil tým z Botanické zahrady a Botanického muzea v Berlíně a Museum für Naturkunde Berlin svůj plán na různých konferencích a organizovaných workshopech s různými vědeckými komunitami. Byli schopni shromáždit požadavky na odpovídající datový standard. Zjištění z těchto workshopů byla také použita k revizi jednotlivých prvků a vytvoření schématu aplikace. A po fázi financování si obě instituce zachovají standard a budou pracovat na novém vývoji.
Vzhledem k tomu, že od jeho vydání neuplynulo mnoho času, systém ABCD 3.0 dosud od komunity neobdržel mnoho zpětné vazby. Odpovědi týkající se nových možností, které umožňuje, však byly pozitivní. Dřívější verze ABCD 2.06 je ratifikovaným standardem TDWG (Biodiversity Information Standards). V letošním roce je plánována ratifikace ABCD 3.0. Kromě odborného přezkumu provozuje TDWG (Biodiversity Information Standards) komunitní přezkum, jehož prostřednictvím je každý vyzván, aby poskytl zpětnou vazbu a nápady na zlepšení.
Co bude dál?
Budoucnost ABCD 3.0 a jeho role jako hlavního standardu pro projekty a iniciativy v oblasti výzkumné infrastruktury v Evropě je jasná. Tým, který stojí za ABCD 3.0, doufá, že bude těsněji spolupracovat s odborníky na další oborové standardy týkající se konkrétních témat, jako jsou vzorky vědy o Zemi, a že bude schopen správně citovat prvky ostatních před vytvořením nových, což je velký krok směrem k interoperabilnějším a vzájemně propojeným datům z přírodní historie, a to v souladu se zásadami propojených otevřených dat.
Další informace o ABCD 3.0 najdete na adrese abcd.tdwg.org/ a na GitHubu.
Pokud máte zájem dozvědět se více o taxonomiích pro údaje o biologické rozmanitosti, můžete si přečíst příspěvek Jörga Holetscheka.