Juurdepääsu bioloogiliste kogude andmetele (ABCD) skeem on pikaajaline, arenev ja kõikehõlmav standard juurdepääsuks loodusajaloo kogudest ja välivaatlustest pärit isendite andmetele, mida tuntakse ka bioloogilise mitmekesisuse esmaste andmetena, ning nende andmete vahetamiseks. See on kooskõlas mitme olemasoleva andmestandardiga. Varaga tagatud kommertsväärtpaberite direktiivi kohaldamise potentsiaal laieneb sisevõrkudele või ettevõttesisesele juurdepääsule varasematele andmetele. ABCD on ka üks mitmest mudelist, mida OpenUp! agregaator saab EDM-ile teisendada ja kaardistada. Sisuteenuse pakkujad edastavad oma andmed ABCD (EFG) skeemis OpenUp!-le, kasutades BioCASe tehnoloogiat, tehes oma sisu Europeana kogudes vabalt kättesaadavaks.
Juba praegu on ette nähtud, et ABCD on loodusloo kogude peamine standard, mida kasutatakse nii praegustes kui ka tulevastes projektides ja teadustaristu algatustes Euroopas.
Mis on uut?
Mida on täiustatud ABCD 3.0-ga? Palju. Töötati välja uus XML-skeem ja tehti muudatusi elementide taaskasutamise osas (lihtsustamine, ühtsem nimetamine jne). Täideti ka kogukonna taotlused ja saavutati vajalik ühtlustamine ABCD 3.0 ontoloogiaga. Huvitaval kombel on see esimene kord, kui ABCD-d kirjeldatakse XML-i ja ontoloogiana. See suurendab standardi rakendamist ja kasutamist semantiliste päringute kaudu ning on aluseks tarkvara ja teenuste edasisele arengule semantilises veebikeskkonnas. Lisaks saab luua erinevaid rakendusskeeme, mis integreerivad ABCD ontoloogia elemente ja palju muud. See aitab kasutajatel kindlaks määrata kõige sobivamad elemendid oma andmete avaldamiseks.
Pilt: Miltitzia lutea (Hook. & Arn.) A. DC., Kuninglik botaanikaaed Kew. Teenuseosutaja: OpenUp! Litsents: Creative Commonsi omistamine 4.0
Esimeseks kasutusjuhtumiks töötati välja Zooloogilise Kogumise Andmete Rakendusskeem. See XML-skeem on ABCD 3.0 alamhulk ja sisaldab ainult elemente, mis on olulised zooloogilisi kogumisobjekte kirjeldava teabe avaldamiseks ja vahetamiseks. Lisaks üldise tähtsusega elementidele (nt kontaktisik, hoiuasutus) on lisatud ka konkreetsemad elemendid, nagu teaduslik nimetus, proovi ettevalmistamine või selle arenguetapp. Kavandatakse ka geoteaduslike kollektsiooniobjektide, sealhulgas mineraalide/kivimite, fossiilide ja meteoriitide rakendusi.
Need muudatused ja uuendused võimaldasid ABCD-l tehnoloogilise ökosüsteemi dünaamiliste muutustega sammu pidada. 20 aastat tagasi töötati ABCD välja ainult XML-standardina, mis oli hierarhiliselt struktureeritud umbes 1500 üksikelemendiga. See oli selleks ajaks ideaalne, kuna XML on nii inim- kui ka masinloetav. Kuid nüüd on olemas uued võimalused - üksikud elemendid on lahendatavad ja kontseptsioone saab siduda teiste standarditega.
Kogukonna vajadused ja tagasiside
Aja jooksul (2015-2019) töötati välja ABCD 3.0, Berliini botaanikaaia ja botaanikamuuseumi ning Berliini Naturkunde muuseumi meeskond tutvustas oma plaani erinevatel konverentsidel ja korraldas seminare erinevate teadusringkondadega. Nad suutsid koguda nõudeid asjakohasele andmestandardile. Nende seminaride tulemusi kasutati ka üksikute elementide läbivaatamiseks ja rakendusskeemide loomiseks. Pärast rahastamisetappi säilitavad mõlemad institutsioonid standardi ja töötavad uute arengutega.
Kuna ABCD 3.0 avaldamisest ei ole palju aega möödas, ei ole see kogukonnalt veel palju tagasisidet saanud. Vastused uutele võimalustele, mida see võimaldab, on siiski olnud positiivsed. Varasem versioon, ABCD 2.06, on ratifitseeritud TDWG standard (bioloogilise mitmekesisuse teabe standardid). Sel aastal on kavas ratifitseerida ABCD 3.0. Lisaks eksperdihinnangule korraldab TDWG (Biodiversity Information Standards – bioloogilise mitmekesisuse teabestandardid) kogukonnaülevaate, mille kaudu kutsutakse kõiki üles andma tagasisidet ja esitama ideid olukorra parandamiseks.
Mis järgmiseks?
Tulevik on helge ABCD 3.0 ja selle rolli jaoks Euroopa projektide ja teadustaristu algatuste põhistandardina. ABCD 3.0 meeskond loodab teha tihedamat koostööd teiste domeenistandardite ekspertidega konkreetsetel teemadel, nagu näiteks maateaduste näidised, ja omada võimet tsiteerida üksteise elemente õigesti enne uute loomist, mis on suur samm koostalitlusvõimelisemate ja omavahel seotud loodusajaloo andmete suunas, järgides seotud avatud andmete põhimõtteid.
ABCD 3.0 kohta lisateabe saamiseks leiate skeemi aadressil abcd.tdwg.org/ ja GitHub.
Kui soovite rohkem teada saada elurikkuse andmete taksonoomia kohta, lugege Jörg Holetscheki postitust.