Shema pristupa podacima o biološkim zbirkama (ABCD) dugogodišnji je, evoluirajući i sveobuhvatni standard za pristup i razmjenu podataka o uzorcima iz zbirki prirodne povijesti i terenskih promatranja poznat i kao primarni podaci o biološkoj raznolikosti. Kompatibilan je s nekoliko postojećih standarda za podatke. Potencijal za primjenu ABCD-a obuhvaća interne mreže ili interni pristup naslijeđenim podacima. ABCD je također jedan od nekoliko modela koje OpenUp! agregator može transformirati i mapirati u EDM. Pružatelji sadržaja isporučuju svoje podatke u shemi ABCD(EFG) OpenUp! koristeći tehnologiju BioCASe, čineći njihov sadržaj slobodno dostupnim na Europeana Collections.
Već je predviđeno da će ABCD biti glavni standard za zbirke prirodne povijesti koje se upotrebljavaju u trenutačnim i budućim projektima i inicijativama za istraživačku infrastrukturu u Europi.
Što je novo?
Što je poboljšano s ABCD 3.0? Puno. Razvijena je nova XML shema i napravljene su izmjene u pogledu ponovne uporabe elemenata (pojednostavnjenje, dosljednije imenovanje itd.). Ispunjeni su i zahtjevi zajednice te je postignuta potrebna usklađenost s ontologijom ABCD 3.0. Uzbudljivo, to je prvi put da je ABCD opisan kao XML i ontologija. To povećava primjenu i korištenje standarda kroz semantičke upite i služi kao osnova za budući razvoj softvera i usluga u semantičkom web okruženju. Osim toga, mogu se stvoriti različite sheme primjene koje integriraju elemente iz ontologije ABCD-a i još mnogo toga. To korisnicima pomaže u određivanju najprikladnijih elemenata za objavu njihovih podataka.
Slika: Miltitzia lutea (Hook. & Arn.) A. DC., Kraljevski botanički vrt Kew. Pružatelj: Otvori! Dozvola: Creative Commons Imenovanje 4.0
Za prvi slučaj uporabe razvijen je aplikacijski shema za podatke zoološkog prikupljanja. Ova shema XML-a podskup je ABCD-a 3.0 i sadržava samo elemente važne za objavljivanje i razmjenu informacija kojima se opisuju predmeti zoološkog prikupljanja. Osim elemenata od opće važnosti (npr. osoba za kontakt, ustanova za držanje), uključeni su i konkretniji elementi kao što su znanstveno ime, priprema uzorka ili njegova faza razvoja. Više Primjena Schemata su planirani, uključujući one za geoznanstvene zbirke objekata, uključujući minerala / stijene, fosila i meteorita.
Te promjene i ažuriranja omogućili su ABCD-u da prati dinamične promjene u tehnološkom ekosustavu. Prije 20 godina, ABCD je razvijen isključivo kao XML standard koji je bio hijerarhijski strukturiran s oko 1.500 pojedinačnih elemenata. Bilo je savršeno za to vrijeme jer je XML i ljudski i strojno čitljiv. Međutim, sada postoje nove mogućnosti – pojedinačni elementi mogu se riješiti, a koncepti se mogu povezati s drugim standardima.
Potrebe zajednice i povratne informacije
Tijekom vremena (2015-2019) razvijen je ABCD 3.0, tim iz Botaničkog vrta i Botaničkog muzeja Berlin i Muzeja für Naturkunde Berlin predstavio je svoj plan na raznim konferencijama i organizirao radionice s različitim znanstvenim zajednicama. Uspjeli su prikupiti zahtjeve za odgovarajući standard podataka. Rezultati tih radionica upotrijebljeni su i za reviziju pojedinačnih elemenata i izradu programa Application Schemata. Nakon faze financiranja obje institucije zadržat će standard i raditi na novim kretanjima.
Budući da od njegova objavljivanja nije prošlo mnogo vremena, ABCD 3.0 još nije dobio mnogo povratnih informacija od zajednice. Međutim, odgovori u pogledu novih mogućnosti koje ona omogućuje bili su pozitivni. Bivša verzija, ABCD 2.06, je ratificirani TDWG standard (Biodiversity Information Standards). Ratifikacija ABCD-a 3.0 planirana je za ovu godinu. Osim stručnog pregleda, TDWG (Biodiversity Information Standards) provodi pregled zajednice, putem kojeg su svi pozvani dati povratne informacije i ideje za poboljšanje.
Što je sljedeće?
Budućnost je svijetla za ABCD 3.0 i njegovu ulogu kao glavnog standarda za projekte i inicijative istraživačke infrastrukture u Europi. Tim koji stoji iza ABCD 3.0 nada se da će bliže surađivati sa stručnjacima na drugim standardima domene o određenim temama kao što su primjerci iz znanosti o zemlji i da će imati sposobnost ispravnog navođenja elemenata drugih prije stvaranja novih, što je veliki korak prema interoperabilnijim i međusobno povezanim podacima o prirodnoj povijesti, slijedeći načela povezanih otvorenih podataka.
Za više informacija o sustavu ABCD 3.0 Schema možete pronaći na abcd.tdwg.org/ i na GitHubu.
Ako želite saznati više o taksonomijama za podatke o biološkoj raznolikosti, možete pročitati post Jörga Holetscheka.