A világ múzeumaiban található természettudományi gyűjtemények hatalmas mennyiségű megőrzött biológiai példányt tárolnak, amelyek dokumentálják bolygónk múltbeli és jelenlegi biológiai sokféleségét, beleértve számos kihalt fajt is. Ezek a gyűjtemények olyan tárgyakat tartalmaznak, mint a töltött és a szerelt állatok, a rögzített rovarok, a szárított növények, a magok és a gyümölcsök, valamint mindenféle fosszíliák. A múltban ezeknek a példányoknak a többsége csak a tudósok számára volt hozzáférhető, de ma a digitalizálás egyre láthatóbbá teszi őket a nyilvánosság számára. A képek és 3D modellek virtuális galériái, valamint a videók és hangfájlok lehetővé teszik a múzeum raktárainak rejtett kincseinek feltárását, amelyek általában a rendszeres látogatók számára nem elérhetők. Az Europeana természettudományi aggregátora, az OpenUp! jelenleg 34 intézmény 8,7 millió objektumával járul hozzá az Europeana portálhoz. Ez az adatszolgáltatás a természettudományok területén meglévő adatinfrastruktúrákra, nevezetesen az európai biológiai gyűjteményekhez való hozzáférést biztosító szolgáltatásra és a biológiai sokféleséggel kapcsolatos globális információs eszközre támaszkodik.
![Ursus thibetanus G.[Baron] Cuvier, 1823, Museumfür Naturkunde Berlin, Németország, CC BY-SA](/files/Images/Blog_images/2019-01/Ursusthibetanus.jpeg)
Ezeknek a tárgyaknak az Europeana gyűjteményekben való megtalálásához a leggyakoribb hozzáférési pont a szervezet neve. A biológusok a fajok jelölésére binomiális neveket használnak, amelyek két részből állnak, mint például az Ursus maritimus a jegesmedve esetében. A különböző nyelvek közönséges neveivel ellentétben ezeket a (latinizált) neveket nemzetközi szinten használják. A bizonyos jellemzőkkel rendelkező fajok nemzetségekbe vannak csoportosítva, amelyek viszont családokba vannak csoportosítva. A biológusok (taxonómusok) a közös jellemzőkkel és ősökkel rendelkező szervezetek több hierarchikus csoportjának (úgynevezett taxonómiák) meghatározásával taxonómiákat hoznak létre. Az Ursus maritimus faj egy ilyen taxonómia alsó szintjén helyezkedik el, az Ursus arctos (barna medve) és az Ursus thibetanus (ázsiai fekete medve) fajokkal együtt az Ursus nemzetséghez tartozik, amely viszont az Ursidae családhoz tartozik; A legfelső szint az Animalia, mint királyság.
A taxonómiák a fajok biológiai sokféleségének és evolúciójának megértését képviselik, amely állandó kutatás tárgyát képezi. Következésképpen a taxonómiák állandó áramlásban vannak. Ahogy új fajokat fedeznek fel, új neveket fognak hozzáadni. A szisztematikus kutatások felfedezhetik, hogy egy bizonyos faj szorosabban kapcsolódik egy másik nemzetséghez, ezért a faj binomiális egy részét meg kell változtatni. Előfordulhat, hogy egy nemzetség összeolvad egy másik nemzetséggel, vagy több nemzetségre oszlik, ami több faj nevének megváltoztatását igényli. Egész taxoncsoportok helyezhetők át a hierarchikus fa más részeire a közös származással kapcsolatban újonnan felfedezett ismeretek eredményeként, például olyan esetekben, amikor a hagyományosan használt morfológiai jellemzőket a molekuláris bizonyítékok fényében újra kell gondolni. Az olyan sajátosságok, mint a homonimák (különböző fajok azonos nevei) és a szinonimák (egy faj több neve) súlyosbítják a taxonómiákkal való foglalkozás nehézségeit. Az ilyen dinamikus adatok kezelésének összetettsége a taxonómiai számítástechnika új területét eredményezte.
A hagyományos taxonómiák gyakran a szervezetek meghatározott csoportjával foglalkoznak, például egy bizonyos családdal, osztállyal vagy királysággal, és egy bizonyos földrajzi régióra utalnak, amelyben a leírt csoport jól ismert és dokumentált. Ilyenek például a regionális „taxonómiai ellenőrzőlisták”, mint például az Euro + Med PlantBase (Európa és a földközi-tengeri térség érrendszeri növényei) és a Fauna Europaea (európai szárazföldi és édesvízi állatok), amelyek számos intézmény taxonómusainak közös erőfeszítései, és amelyeket folyamatosan frissítenek. Az olyan kezdeményezések, mint a páneurópai fajkönyvtár-infrastruktúra (PESI), a különböző közösségek taxonómiáit egyetlen, minden taxonra kiterjedő ellenőrzőlistába egyesítik. Hasonló kezdeményezések léteznek globális szinten is: Az Életkatalógus 168 taxonómiai adatbázis adatait gyűjti össze az ismert állatfajok, növények, gombák és mikroorganizmusok hiteles indexébe, amely jelenleg 1,8 millió fajt sorol fel a világ 1,9 millió megnevezett fajából. A GBIF gerinctaxonómiája az Életkatalógusra épül, és 56 forrásból származó automatikus folyamat keretében rendszeresen összeszerelik.
Mondanom sem kell, hogy az a döntés, hogy melyik ellenőrzőlistát kell használni a gyűjteményhez, a taxonómiai és földrajzi lefedettségtől függ. A taxonómiákat folyamatosan frissítik, ezért rendszeres időközönként össze kell egyeztetni a gyűjteményi objektumokat az említett ellenőrző listák bármelyikével. Legtöbbjük olyan webes szolgáltatásokon keresztül érhető el, amelyek lehetővé teszik a meglévő infrastruktúrákba és termékekbe való egyszerű integrációt. A regionális és globális szinonimizált ellenőrzőlisták, például a PESI és az Élet katalógusa felhasználhatók olyan lekérdezésbővítési mechanizmusok végrehajtására, amelyek kiterjesztik a taxon felhasználói lekérdezéseit a taxon összes ismert szinonimájára. Az ilyen lekérdezésbővítési funkciók már a legkorszerűbbek a biológiai sokféleséggel foglalkozó portálokon.
A természettudományi példányok esetében a kapcsolt nyíltadat-azonosítók a közelmúltban széles körben elterjedtek, például az Európai Taxonómiai Létesítmények Konzorciuma (CETAF) HTTP-stabil azonosítóinak bevezetésével. A taxonok esetében hasonló kezdeményezéseket vitatnak meg, de a bennük rejlő bizonytalanság és a taxonómiák folyamatos áramlása miatt a taxonok nehezen érthetők meg és akadályozzák ezeket az erőfeszítéseket.
A kanonikus taxonómiák alkalmazásával nem megoldható probléma a téves azonosítások kérdése – a példányokat összetévesztik egy bizonyos fajjal, ami azt eredményezi, hogy a tárgyakra helytelen neveket használnak. Ez nem kerülhető el teljesen, tekintettel arra, hogy egyes gyűjtemények több millió példányt tartalmaznak, amelyeket nem lehet folyamatosan frissíteni. Ezt figyelembe kell venni az adatok felhasználásakor.
Az OpenUp! esetében nem használnak egységes taxonómiát a mintaobjektumokhoz. Mivel az adatokat olyan intézmények szolgáltatják, amelyek szakterületük szakértői, az OpenUp-ba való betáplálás előtt megfelelő ellenőrzőlistákat kell alkalmazniuk az adataikra. A hozzáférhetőség növelése érdekében azonban az OpenUp! 300 nyelven és dialektusban közismert nevekkel gazdagítja az objektumok metaadatait, így egy faj (bizonyos bizonyossággal) megtalálható anélkül, hogy ismerné tudományos nevét. A további gazdagítás magában foglalja a biológiai sokféleséggel kapcsolatos szakirodalom online hozzáférhetővé tételével foglalkozó konzorcium, a Biodiversity Heritage Library (BHL) által rendelkezésre bocsátott tudományos szakirodalomra mutató linkeket.
Elismerések: Szeretném megköszönni Walter Berendsohn, Petra Böttinger, Gabi Dröge, Anton Güntsch, Agnes Kirchhoff és Gerda Koch kollégáim értékes észrevételeit és javaslatait.
Kép attribútumok:
- Ursus thibetanus G.[Baron] Cuvier, 1823, Museumfür Naturkunde Berlin, Németország, CC BY-SA
- A biológiai osztályozás hét fő taxonómiai rangja, Halasz Péter, Wikimedia Commons, Public Domain.
- Testudo hermanni Gmelin, 1789, Muséum national d'Histoire naturelle, Franciaország, CC BY-NC-ND
