Природонаучните колекции в музеите по света са хранилища на огромни количества запазени биологични екземпляри, които документират миналото и настоящето биологично разнообразие на нашата планета, включително много изчезнали видове. Тези колекции съдържат предмети като пълнени и монтирани животни, закачени насекоми, сушени растения, семена и плодове, както и всички видове фосили. В миналото повечето от тези екземпляри са били достъпни само за учени, но днес дигитализацията ги прави все по-видими за обществеността. Виртуалните галерии с изображения и 3D модели, както и видеоклиповете и аудио файловете позволяват да се разгледат скритите съкровища на складовете на музея, които обикновено са извън границите за редовни посетители. Обединителят по естествена история на Europeana, OpenUp!, понастоящем допринася за портала Europeana с 8,7 милиона обекта от 34 институции. Това предоставяне на данни се основава на установени инфраструктури за данни в областта на естествената история, а именно услугата за достъп до биологични колекции за Европа и Глобалния информационен механизъм за биологичното разнообразие.
![Ursus thibetanus G.[Baron] Cuvier, 1823, Museumfür Naturkunde Berlin, Германия, CC BY-SA](/files/Images/Blog_images/2019-01/Ursusthibetanus.jpeg)
За да намерите тези предмети в колекциите Europeana, най-често срещаната точка за достъп е името на организма. Биолозите използват биноми — имена, състоящи се от две части, като например Ursus maritimus за полярната мечка — за обозначаване на видовете. За разлика от общоприетите наименования на различни езици, тези (латински) наименования се използват в международен план. Видовете, които споделят определени характеристики, са групирани в родове, които от своя страна са групирани в семейства. Чрез дефиниране на няколко йерархични групи организми с общи характеристики и потекло (така наречените таксономии), биолозите (таксономистите) създават таксономии. Видът Ursus maritimus би бил на най-ниското ниво на такава таксономия, заедно с Ursus arctos (кафява мечка) и Ursus thibetanus (азиатска черна мечка), той принадлежи към рода Ursus, който от своя страна принадлежи към семейството на Ursidae; на най-високо ниво ще бъде Animalia като царство.
Таксономиите представляват нашето разбиране за биологичното разнообразие и еволюцията на видовете, което е предмет на постоянни изследвания. Следователно таксономиите са в постоянен поток. Когато бъдат открити нови видове, ще бъдат добавени нови имена. Систематичните изследвания могат да открият, че даден вид е по-тясно свързан с друг род, така че част от биномния бином на вида трябва да бъде променена. Един род може да се слее с друг род или да се раздели на няколко рода, което изисква промяна на имената на няколко вида. Цели таксонови групи могат да бъдат преместени в други части на йерархичното дърво в резултат на новооткрити знания за общия произход, например в случаите, когато традиционно използваните морфологични характеристики трябва да бъдат преразгледани в светлината на молекулярните доказателства. Особености като омоними (идентични наименования за различни видове) и синоними (няколко наименования за един вид) допринасят за трудностите, свързани с таксономиите. Сложността на обработката на такива динамични данни породи новата област на таксономичните изчисления.
Традиционните таксономии често се занимават с определена група организми, например определено семейство, клас или царство, и се отнасят до определен географски регион, в който описаната група е добре позната и документирана. Примери за това са регионалните „таксономични контролни списъци“ като Euro + Med PlantBase (съдови растения от Европа и Средиземноморския регион) и Fauna Europaea (европейски сухоземни и сладководни животни), които са съвместни усилия на таксономисти от много институции и непрекъснато се актуализират. Инициативи като общоевропейската инфраструктура за управление на видовете (PESI) обединяват таксономии от различни общности в единен контролен списък, обхващащ всички такси. Подобни инициативи съществуват на световно равнище: Каталогът на живота обединява данни от 168 таксономични бази данни в авторитетен индекс на известни видове животни, растения, гъби и микроорганизми, в който в момента са изброени 1,8 милиона от общо 1,9 милиона известни видове в света. Таксономията „Гръбнак“ на GBIF се основава на Каталога на живота и редовно се събира в автоматичен процес от 56 източника.
Излишно е да се споменава, че решението кой контролен списък следва да се използва за дадена колекция зависи от таксономичното и географското покритие. Таксономиите претърпяват постоянни актуализации, така че съпоставянето на предметите за събиране с някой от споменатите контролни списъци трябва да се извършва на редовни интервали. Повечето от тях са достъпни чрез уеб услуги, които позволяват лесна интеграция в съществуващи инфраструктури и продукти. Регионалните и глобалните синонимизирани контролни списъци като PESI и Каталога на живота могат да се използват за прилагане на механизми за разширяване на заявките, които разширяват потребителските заявки за даден таксон до всички известни синоними на този таксон. Такива функции за разширяване на търсенето вече са най-съвременни в порталите за биологично разнообразие.
За екземпляри от естествената история идентификаторите на свързаните отворени данни са широко използвани в близкото минало, например чрез прилагане на HTTP стабилни идентификатори на Консорциума на европейските таксономични съоръжения (CETAF). За таксоните се обсъждат подобни инициативи, но присъщата несигурност и постоянният поток от таксономии правят таксоните нелесни за разбиране и възпрепятстват тези усилия.
Проблем, който не може да бъде решен чрез използването на канонични таксономии, е проблемът с погрешното идентифициране — екземпляри, объркани с определен вид, което води до използване на неправилни имена за предмети. Това не може да бъде напълно избегнато, като се има предвид, че някои колекции съдържат милиони екземпляри, които не могат да бъдат постоянно актуализирани. Това трябва да се има предвид при използването на данните.
За OpenUp! не се използва единна таксономия за обектите на образците. Тъй като данните се предоставят от институции, които са експерти в съответните си области, от тях се очаква да прилагат подходящи контролни списъци за своите данни, преди да ги предоставят на OpenUp. Въпреки това, за да се увеличи достъпността, OpenUp! обогатява метаданните на обектите с често срещани имена на 300 езика и диалекта, така че даден вид да може да бъде намерен (с известна сигурност), без да знае научното му наименование. Допълнителното обогатяване включва връзки към научната литература, налична в Библиотеката на наследството на биологичното разнообразие (BHL) — консорциум, посветен на осигуряването на онлайн достъп до наследената литература относно биологичното разнообразие.
Потвърждения: Бих искал да благодаря на моите колеги Walter Berendsohn, Petra Böttinger, Gabi Dröge, Anton Güntsch, Agnes Kirchhoff и Gerda Koch за ценните им коментари и предложения.
Атрибути на изображението:
- Ursus thibetanus G.[Baron] Cuvier, 1823, Museumfür Naturkunde Berlin, Германия, CC BY-SA
- Седемте основни таксономични ранга на биологичната класификация, Peter Halasz, Общомедия, Public Domain.
- Testudo hermanni Gmelin, 1789 г., Muséum national d'Histoire _naturelle,_Франция, CC BY-NC-ND
